呼吸与危重症医学科设有5个辅助功能检查室：
变态反应实验室：该检查室主要分两部分，过敏原检测及脱敏治疗；呼出气一氧化氮测定分析。前者采用Phaidia过敏原定量检测技术，该技术不受患者年龄、皮肤状况、用药、疾病和怀孕状态的因素的影响；有灵敏度高、特异性强、结果可溯源等优点，阳性预计值及阴性预计值均能达到90%以上。与同类方法相比，最低定量限可达到0.1KUA/L.目前可以开展的项目覆盖了常见室内过敏原(户尘螨、粉尘螨、猫够皮屑、霉菌等)、室外过敏原(多种杂草花粉)、食物过敏原(鸡蛋白、牛奶、小麦、花生、大豆、芝麻、坚果等)工28种。呼出气一氧化氮检测具有简便、快速、安全，能够准确反映出气道炎症的严重程度且患者易于接受的特点，具有广泛的应用前景。
肺功能检查室：该检查室可开展肺功能全项(包括弥散功能、通气功能、小气道功能、气道阻力等方面检测)、支气管舒张试验检测。
睡眠呼吸障碍监测室：采用美国邦德安百NOXT3全数字无线睡眠记录系统，该仪器采用全新胸腹绑带技术，通过无线连接，最大限度解放患者。RIP技术精准测量呼吸运动，高质量信号采集。包括口鼻气流+鼾声+血氧饱和度+胸腹运动等，可用于初步筛查OSAHS患者，也可用于评价疗效及随访。
支气管镜检查室：可开展超声引导下经支气管镜行淋巴结活检术(TBNA)、气道球囊扩张、气道内支架植入术等介入技术，窄波成像鉴别良恶性病变术、经支气管行肺活检术、无痛支气管镜术及传统的支气管镜检查项目--支气管镜下粘膜活检、肺泡盥洗、刷检等。其中无痛支气管镜术采用静脉麻醉联合局部麻醉的方法，使患者在毫无痛苦的状态下顺利完成检查。已开展快速现场评价，简称ROSE，包括快速现场细胞学评价(C-ROSE)，快速现场微生物学评价(M-ROSE)。该技术通过改良的瑞氏染色(WF染色)，耗时仅30秒，多数情况下1min即可在显微镜下观察，通过观察脱落组织细胞学形态即可快速对疾病作出评价，如肺恶性肿瘤的病理分型；如真菌、部分寄生虫、结核等鉴别，对临床疾病的诊断提供了更好、更快等辅助检查方式。
内科胸腔镜检查室：该技术在呼吸与危重症医学科领域应用甚广，主要包括胸膜肿瘤的诊断与治疗；气胸的诊断与治疗；肺癌的诊断与分期；胸腔积液原因的鉴别；顽固性良性胸水的治疗；胸腔镜检查活检可提供多块、有选择性标本，确诊率可显著提高。其标本结核培养率可达78%，比胸水和穿刺活检联合应用培养阳性率(39%)增加一倍。
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